近日,,太陽(yáng)集團(tuán)8722網(wǎng)站孫廣宇教授團(tuán)隊(duì)在《Environmental Microbiology》期刊在線發(fā)表了題為“Comparison of mitochondrial genomes provides insights into intron dynamics and evolution in Botryosphaeria dothidea and B. kuwatsukai ”的研究論文,。我院已畢業(yè)博士研究生王博為論文第一作者,孫廣宇教授為通訊作者,。
該研究測(cè)序了蘋(píng)果輪紋病病原葡萄座腔菌( Botryosphaeria dothidea )和粗皮葡萄座腔菌( B. kuwatsukai )的線粒體基因組序列,,并在群體水平上比較分析了線粒體基因組的結(jié)構(gòu)差異和內(nèi)含子進(jìn)化,。發(fā)現(xiàn)兩物種的線粒體基因組內(nèi)含子數(shù)目顯著擴(kuò)張,內(nèi)含子獲得或丟失是基因組大小差異的主要原因,。在兩個(gè)物種線粒體基因組內(nèi),,都發(fā)現(xiàn)多種內(nèi)含子分布模式,這些分布模式有望開(kāi)發(fā)為種群多樣性生態(tài)學(xué)研究新的“分子標(biāo)記”,。另外,,線粒體基因系統(tǒng)發(fā)育支持葡萄座腔菌和粗皮葡萄座腔菌是獨(dú)立物種。
蘋(píng)果輪紋病是一種世界性病害,,從1907年日本最早報(bào)道果實(shí)輪紋病到現(xiàn)在已有一百多年的歷史,。歐美國(guó)家稱之為蘋(píng)果白腐病(white rot),,中國(guó),、日本等東亞國(guó)家稱之為輪紋病(ring rot,, rinmon-byo ),。蘋(píng)果輪紋病病原名稱使用十分混亂, B. berengeriana ,, B. dothidea ,, B. berengeriana f. sp. piricola , Macrophama kawatsukai 及 Physalospora piricola 等都被廣泛使用,。世界上對(duì)蘋(píng)果輪紋病與白腐病是否一種病害,,兩種病害由一種病原還是不同病原引起一直爭(zhēng)論不休。孫廣宇教授團(tuán)隊(duì)通過(guò)多年研究,,發(fā)現(xiàn)“蘋(píng)果輪紋病”由兩種病原菌葡萄座腔菌( B. dothidea )和粗皮葡萄座腔菌( B. kuwatsukai )引起,,它們?cè)诜肿酉到y(tǒng)演化、致病性,、寄主范圍、生物特性等方面都存在顯著差異,;比較基因組分析也發(fā)現(xiàn),,兩種病原菌大約在兩百萬(wàn)年前分化成獨(dú)立物種;本研究進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)線粒體基因結(jié)構(gòu)系統(tǒng)演化也支持兩個(gè)物種的分化,。這些研究相互印證,,給百年來(lái)爭(zhēng)論的輪紋病問(wèn)題一個(gè)圓滿的答案:發(fā)生在東亞地區(qū)的蘋(píng)果“輪紋?。?rinmon-byo )”與歐美的白腐病是同一種病害,但都由兩種病原引起,。該研究成果也為我國(guó)蘋(píng)果出口掃除了檢疫上的障礙,。
本研究得到農(nóng)業(yè)部和財(cái)政部蘋(píng)果產(chǎn)業(yè)體系和國(guó)家自然科學(xué)基金委的資助。
論文鏈接:https://sfamjournals.onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/1462-2920.15608